10.11.1987 thành lập Atlantic Airways. Chính phủ tự trị Faroe có 51% và Cimber Air (Đan Mạch) 49% vốn. (Trước đó từ năm 1963 bắt đầu có tuyến bay thường xuyên giữa Quần đảo Faroe và Đan Mạch do hãng hàng không Maersk Air của Tập đoàn A.P.Moller-Maersk độc quyền đảm nhiệm)
28.3.1988 Atlantic Airways có chuyến bay đầu tiên từ phi trường Vágar tới Copenhagen bằng máy bay BAe 146 do hãng British Aerospace sản xuất.
Năm 1989, chính phủ tự trị quần đảo Faroe mua lại cổ phần của Cimber Air và sở hữu toàn bộ hãng này.
Đầu thập niên 1990 nền kinh tế của quần đảo Faroe suy thoái. Chính phủ tự trị phải tài trợ cho Atlantic Airways 75 triệu krone Đan Mạch.
Năm 1994, hãng nhận 2 máy bay trực thăng từ Công ty SL Helicopters để mở các tuyến bay nội địa tới các đảo của quần đảo. (Trước đó - từ năm 1980 - do công ty SL Helicopters đảm nhiệm)
Năm 2000, Atlantic Airways mua máy bay BAe 146 thứ hai để mở tuyến bay tới London (Anh quốc) và Oslo (Na Uy). Cùng năm hãng cũng mở các tuyến bay tới sân bay Aalborg (Đan Mạch), Stavanger, Stord (Na Uy) và Edinburgh (Scotland)
Năm 2006, hãng bãi bỏ tuyến bay tới Stord (Na Uy), Edinburgh (Scotland) và thay bằng tuyến bay từ Vágar tới Quần đảo Shetland và từ quần đảo Shetland tới London. Năm 2006 hãng có doanh số 520 triệu krone Đan Mạch
Từ 10.12.2007, Atlantic Airways ghi danh ở thị trường chứng khoán Iceland. Chính phủ tự trị quần đảo Faroe quyết định tư nhân hóa hãng Atlantic Airways và đã bán 33% cổ phần, Chính phủ cũng dự định bán tiếp 33% cổ phần trong năm 2008 [2][3][4]
